Üldkoosolek

Ettevõtte üldkoosoleku rolli täidab ainuosanikuna läbi kirikuvalitsuse ehk konsistooriumi Eesti Evangeelne Luterlik Kirik (EELK). 

Nõukogu

Kiriku Varahalduse nõukogu koosneb viiest kuni seitsmest liikmest. Nõukogu koosseisu ja volituste kestvuse määrab ning nõukogu liikmed kutsub tagasi üldkoosolek. Nõukogu liikmed on  Andrus Mõttus (esimees), Jüri Ehasalu, Hindrek Leppsalu, Mati Maanas, Urmas Paju.

Juhatus

Kiriku Varahaldust juhib ühe kuni kolme liikmeline juhatus. Juhatuse liikmed valib ning kutsub tagasi nõukogu. Juhatuse liige on Jüri Parbo (juhataja).